肠道微生物已被证实对人体健康中发挥了重要的作用。与微生物的相互作用的好处是特别相关的免疫系统，预防对病原体，以及对疾病，如过敏保护的发展，1型糖尿病和肥胖。

人类肠道微生物的定殖主要是从出生开始。一旦宝宝出生后，它被暴露在孕产妇和环境微生物群落，这将塑造新生儿的肠道微生物。

母体-新生儿的菌群转移已被认为是进化性的，并已保存在动物界的几种物种中。它们可以在分娩时通过产道以及通过母乳喂养发生。Bäckhed等证明，与剖腹产新生儿相比，阴道分娩新生儿的肠道细菌谱与母亲的肠道相似。有人认为，可能是由于母体肠道和产道的接近，所以母体肠道提供了一部分微生物群落，可转移到阴道分娩的新生儿中。此外，Asnicar等确定了特定菌株可通过母乳喂养垂直传播。

膳食纤维，特别是益生元，对人体健康的有益效果是已确立的。尤其是在怀孕和哺乳期，益生元降低了产后体重保持的风险，从而降低了长期肥胖的风险，因此，降低了不可传播的慢性疾病的风险。此外，益生元还具有刺激人体肠道有益微生物的能力。在这种情况下，一些研究表明，肠道细菌可经由母乳喂养自相同菌株已被分离母体粪便和母乳的成对样品中被转移到新生儿。

某些细菌，特别是双歧杆菌和乳杆菌，与婴儿和成人健康的益处密切相关。这些细菌可以通过特定化合物（即益生元）的存在来刺激。鉴于益生元可以被宿主微生物利用，从而促进宿主健康，研究调查了孕妇饮食中添加益生元（低聚果糖，FOS）是否会影响母乳菌群。

28名哺乳期妇女接受4.5 g低聚果糖+ 2 g麦芽糊精（FOS组），25名接受2 g麦芽糊精（安慰剂组）治疗20天。干预前后均采集母乳样品。来自样品的DNA用于16S rRNA测序。干预后，细菌属在两组之间没有统计学差异。但是，对于FOS组，从补充开始到结束，成对样本覆盖的轨迹的距离更大（p= 0.0007），表明与对照组相比，母乳菌群的变化更大。线性回归模型表明，产妇年龄影响了补充FOS的反应（p = 0.02）。

研究证明了通过益生元调控母乳菌群是可能的，而产妇年龄会影响这种反应。菌群变化的模式似乎取决于个人。

图. 根据孕妇年龄，FOS（粉红色）或安慰剂（绿色）组在补充之前和之后的Jensen-Shannon距离。最小二乘均数用于比较FOS和安慰剂组之间距离与产妇年龄的回归斜率。

结果表明，年轻母亲受FOS补充的影响更大，而年长母亲对安慰剂组的反应似乎相似。在模型中测试的其他变量没有发现统计学差异，包括孕前BMI（p = 0.8528），第一个月的BMI（p = 0.4705），妊娠期抗生素治疗（p = 0.5896），分娩期抗生素治疗（p = 0.7130），种族（p = 0.2004），儿童人数（p = 0.3381），婴儿性别（p = 0.1832）和第一个月的婴儿喂养时间（p = 0.7154）。