根据台湾行政院卫生署2002年公布的“健康食品之胃肠道功能改善评估方法”可知，如果食品具有（1）促进消化吸收，（2）改善肠内细菌菌相，（3）促进肠道蠕动，帮助维持肠道正常机能等三种功能中任一种功能时，可认为该食品具有改善胃肠道功能。

    低聚糖，即寡糖几乎都能到达肠道末端被双歧杆菌发酵利用，其中木寡糖的生理活性较其它寡糖佳，只需其它寡糖用量的1/4至1/10即可达到促进双歧杆菌增殖并改善肠道菌群的效果。有研究指出，每天摄取0.7～1.4g木寡糖即可改善肠道内菌相，促进双歧杆菌增殖。且双歧杆菌利用木寡糖增殖的过程中，会使肠道发酵产生短链脂肪酸使肠道pH值下降，并抑制肠道有害菌群的滋生及减少肠内菌的腐败物产生。还可以帮助人体合成B族维生素及增强机体免疫力。

     1990年Okazaki等人对木寡糖进行体外与体内试验，结果在体外试验中发现双歧菌属的菌种均可利用木寡糖，但其它肠内有害菌对木寡糖的利用效果却不佳。在人体试验中，每天给予受试者5.0g木寡糖，连续使用三周后，发现粪便中的总菌数不便，但双歧杆菌的比例却明显的增加。有研究报告指出少量寡木糖（0.7g/d）即可改善肠内菌群变化，促进肠内有益菌生长，增加粪便保水力，改善便秘（Okazaki et al.,1991）。亦有报告指出，腹泻者服用木寡糖可改善其排便次数及使其排便量减少，但若摄取过多木寡糖（8g/d），则会引起腹泻（Ohku,1992）。在1991年Kobayashi等学者，分别以10位30～60岁的健康男性为对象，分为三阶段进行实验，分别给予2、5、10g木寡糖，每阶段为期5天，且每阶段间隔9天，期间并去除实验影响因素，如纳豆及含有生菌的食品等，结果显示，未使用木寡糖时腹泻比例为7.7%，使用2.0g木寡糖腹泻的比例降为2%，而5、10g可能因用量稍多，刺激肠道蠕动过快，所以效果较不明显；而在排便次数及粪便硬度方面，使用2.0g木寡糖阶段皆显著低于其他阶段，可能因粪便保水力增加及粪便量增加的缘故。

     木寡糖属于可溶性膳食纤维，但它却不能被人体消化酶系统所分解，直至消化末端才能被肠道菌选择性地发酵利用。肠道中的有害菌（如腐败菌及病原菌等）也无法利用它，因此人体食用后可直达大肠，高选择性地促进人体肠内有益菌—双歧杆菌的生长及增殖，同时抑制病原菌生长及毒素的产生，达到清洁肠道，促进人体健康。